Anhand des CT-Scans wird die Punktionsstelle identifiziert und markiert. Die Positionierung für den Eingriff in Bauch- oder Rückenlage ist abhängig von dieser Punktionsstelle und dem Weg, den die Hohlnadel nehmen muss. Bevor die CT-gesteuerte Drainage beginnt, wird das betreffende Hautareal desinfiziert. Für eine schmerzfreie Behandlung wird mit Lokalanästhesie bzw. Kurznarkose gearbeitet. Unter der computertomographischen Kontrolle wird die Nadel in den Verhalt vorgeschoben. Anschließend wird der Drainagekatheter positioniert, über den Flüssigkeit wie Eiter oder Lymphe abfließen.